Madagaskaras upēm ir strauja straume. Visas salas lielākās upes plūst no austrumiem uz rietumiem.
Betsibuka upe
Upes gultne atrodas salas ziemeļrietumu zemēs. Kopējais straumes garums ir 525 kilometri. Un šī ir viena no lielākajām salu upēm. Betsibuka raksturo ūdens raksturīgā sarkanbrūnā krāsa. Šīs parādības izskaidrojums ir ļoti vienkāršs - upes ūdeņos ir liels nogulumu daudzums, ko upe nes jūrā.
Upes avots atrodas salas centrā (uz ziemeļiem no Antananarivo provinces). Upes izcelsme ir divu upju - Amparihibe un Dzabu - satekā. Pēc tam Betsibuka dodas uz ziemeļiem, uzņemot Ikupa upes ūdeņus (netālu no Maevatanana pilsētas). Betsibuca ieplūst Bumbetuca līča (Mozambikas šaurums) ūdeņos, nokrītot veido deltu. Upes gultne ir kuģojama 130 kilometrus uz augšu no sateces vietas.
Sarkanbrūnā ūdens nokrāsa upē liecina par ekoloģisku katastrofu. Salas virsmas izciršana ir paātrinājusi augsnes erozijas procesu. Rezultātā kopējais ūdens izskalotais zemes daudzums ir neticami milzīgs. Un tā kā tās pārsvarā ir sarkanās laterītiskās augsnes, līdz ar to arī ūdens ēna.
Nogulumi, ko upe nes savos ūdeņos, nosēžas Betsibukas grīvas apakšā. Un tas ir viens no iemesliem Bumbetukas līča dibena aizsērēšanai. Tieši šī iemesla dēļ šeit esošā Mahajanga pilsētas osta tika pārcelta uz salas ārējo krastu, jo draudēja okeāna kuģu nolaišanās uz sēkļa.
Mangoki upe
Upe tek cauri salas dienvidrietumu daļas zemēm. Kopējais Mangoki straumes garums ir 564 kilometri. Un tā ir garākā upe Madagaskarā.
Avots atrodas Fianarantsoa provincē (Centrālās grēdas nogāzes). Pēc tam upe tek uz rietumiem, šķērsojot Tulijaras provinces zemes. Sateces vieta ir Mozambikas šauruma ūdeņi (netālu no Morombes pilsētas). Kad tas tajā ieplūst, tas veido lielu deltu.
Mangoki kanāls iet pa sarežģītu reljefu. Deltas dienvidu daļa ir bagāta ar barjeras salām, sēkļiem un aluviālajām ielejām. Deltas ziemeļu daļā ir daudz purvu un mangrovju.
Maninguri upe
Maninguri upe atrodas Madagaskaras austrumu daļā, un tās kopējais garums ir 260 kilometri. Upes avots ir Alautras ezers. Kopējā upes baseina platība ir 12 645 kvadrātkilometri. Upei raksturīga nemierīga straume. Sateces vieta ir Indijas okeāna ūdeņi (netālu no Ampasina pilsētas).
