Tradicionāli Nepālas upes var iedalīt trīs kategorijās (atkarībā no pārtikas veida). Pirmās ir upes, kuras baro ledāju kušana. Otrās ir upes, kuru izcelsme ir Mahabharatas grēdā. Vēl citi ir dažādi strauti un upes, kuru avots ir Sivalikas grēda.
Bagmati upe
Bagmati iet cauri Nepālas centrālajai daļai un Indijas Biharas štatam. Upes avots ir kalnos, un to veido vairāku nenosauktu strautu saplūšana (apmēram 15 kilometrus no Katmandu).
Bagmati ūdeņi ir svēti gan hinduismā, gan budismā. Upes krastos ir daudz hinduistu tempļu.
Barunas upe
Baruns šķērso Nepālas centrālās daļas austrumu teritorijas un ir Arunas upes labā pieteka.
Upes avots ir Berunas ledāji, kas atrodas Makalu kalnā. Galvenais straumes virziens ir austrumi un dienvidaustrumi. Upe ir daļa no Kosi upes sistēmas, kurā ietilpst tādas lielas upes kā: Aruna; Tamurs; Sun-Kosi; Indravati; Dudh Kosi; Bhola Kosi.
Gandakas upe
Upe plūst caur Nepālas un Indijas teritoriju. Gandak ir viena no četrām lielākajām Nepālas upēm. Upes avots ir Himalajos, divu upju satekā: Muztang Khola; Kjugoma Kola. Augštecē upi sauc par Kali-Gandak. Gandakas saplūšana ir Gangas upes ūdeņi. Upes ieleja bija tirdzniecības ceļš, kas savienoja Indiju un Tibetu.
Gandakas upes ieleja ir interesanta arī ar to, ka sadala Lielo Himalaju grēdu divās daļās, kas iet starp divām virsotnēm - Anapuru un Daulagiri.
Ghaghra upe
Ghaghra iet caur trīs štatu zemēm - Nepālu, Ķīnu un Indiju. Kopējais straumes garums ir 950 kilometri, un šī ir dziļākā ūdens straume, kas baro lielo Gangu.
Upes avots atrodas Tibetas plato teritorijā (dienvidu daļa, Manasarovara ezera apgabals). Ghaghra ir garākā un lielākā upe Nepālā. Galvenais upju barošanās veids: augštecē ir ledāju ūdens un izkusis sniegs; apakšējā daļa tiek barota doji periodā. Upe ir īpaši plūstoša pavasarī un vasarā. Šajā gada laikā Ghaghrā iespējami spēcīgi plūdi. Upes ūdeņi galvenokārt tiek izmantoti apūdeņošanai.
Dudh-Kosi upe
Viena no Nepālas upēm, kas ir viena no augstākajām kalnu upēm ne tikai valstī, bet visā pasaulē. Upes avots ir Gokyo ezers. Tad straume nolaižas Namche-Bazar traktā, kur Dudh-Kosi ūdeņi saplūst ar citu upi-Bhote-Kosi.
Upe ir vienkārši ideāla pludināšanai, taču jāpatur prātā, ka šis maršruts nav piemērots iesācējiem.
Rapti upe
Rapti ir upe Nepālā un Indijā, tās kopējais garums ir 600 kilometri. Upes avots ir Sivalika kalnu teritorijā.
