Moldovas upes veido diezgan blīvu un sazarotu tīklu. Visas valsts upes nes savus ūdeņus līdz Melnās jūras krastam.
Turunchuk upe
Turunchik ir viena no Dņestras ieročiem. Ģeogrāfiski upe atrodas Moldovas un Ukrainas teritorijā. Maksimālais kanāla platums ir trīsdesmit metri ar sešu metru dziļumu.
Upe veidojās kā atzars no 1780. līdz 1785. gadam. Filiāle sākas netālu no Chobruchi ciema (146 km no Dņestras). Turunčiks atgriežas "vecāku" Dņestrī pie Beļjajevkas pilsētas (20 km no straumes).
Turunchuk ir viena no zvejnieku sacensību norises vietām.
Prutas upe
Upes gultne šķērso trīs valstu teritoriju - Ukrainu, Moldovu un Rumāniju. Tā ir Donavas kreisā pieteka, kuras kopējais garums ir 953 kilometri. Upes avots ir Karpatu austrumu daļa (Ivanofrankivskas apgabals).
Pruta ir otra garākā upe valstī. Augštecē Pruta ir tipiska kalnu upe, un tikai tad, kad tā ieiet Moldovas teritorijā, Pruta nomierinās, pārvēršoties par klasisku plakanu upi ar plašu ieleju un zemiem krastiem. Prutas upes gultne ir diezgan līkumota, un šur tur sadalās piedurknēs. Upes palienes apakšējā daļa ir ļoti purvaina.
Reutas upe
Reuta ir viena no Moldovas upēm, kas ir labā Dņestras pieteka. Kopējais straumes garums ir 286 kilometri. Upes avots atrodas netālu no Red-Mare ciema (Dondyushan reģions). Sākotnēji straumei ir dienvidaustrumu virziens, pēc divām virziena maiņām Reuts ieplūst Dņestras (Ustjes ciema) ūdeņos.
Floreshtami un Kazaņaštami reģionā upes gultne iet caur šaurām un dziļām aizām, kas veidojas kaļķakmens iežos. Upes ūdeņi ir ļoti piesārņoti, tāpēc tos izmanto tikai apūdeņošanai.
Alkalijas upe
Caur Ukrainas un Moldovas teritoriju iet neliela upe - tikai 67 kilometrus gara. Satece ir Burnas ezers. Upes ieleju smagi sagrauj ieplakas un dabiskas gravas. Kanāls, kura platums ir līdz astoņiem metriem, ir mēreni tinēts. Upes ūdeņi tiek izmantoti apūdeņošanai.
Upes avots ir viens no dīķiem Moldovā. Kanāls ģeogrāfiski iet caur divu rajonu teritoriju - Tatarbunarsky un Belgorod -Dnestrovsky (Odesas apgabals).
Upes haideris
Hajiders teritoriāli pieder divām valstīm - Ukrainai un Moldovai. Kopējais kanāla garums ir 94 kilometri. Upes avots ir Podoļskas augstienē (netālu no Stefana Vodas pilsētas). Tad tas iet caur trīs rajonu zemēm: Belgorodas-Dņestrovska; Saratova; Tatarbunarsky.
Sateces vieta ir Hajidera ezera ūdeņi. Pati upe uzņem piecdesmit septiņu mazu upju ūdeņus. Un lielākais no visiem ir Kaplans, kas savienojumā ar Hajideru veido nelielu rezervuāru.
