Lietuvas upes pieder Baltijas jūras baseinam, un tām ir diezgan sazarota sistēma.
Sventāja upe
Sventāja ir upe Lietuvā, kas ir Viļjas upes lielākā pieteka. Tā garums ir 246 kilometri. Avots ir Sammaris ezers (Grazutes reģionālā parka teritorija), un tas ietek Viļjas ūdeņos netālu no Ionavas pilsētas.
Sventoji galvenā pieteka ir Širvinta. Upes gultne iet caur trīs pilsētu teritoriju: Anyksciai; Kavarskas; Ukmerģe.
Viļjas upe
Vilija iet cauri Baltkrievijas un Lietuvas teritorijai. Kopējais kanāla garums ir 510 kilometri. No tiem 228 kilometri iet caur Lietuvas zemēm.
Lietuvā upi sauc par Neris un tā ir otrā garākā Lietuvas upe. Tas savieno divas lielas pilsētas - Viļņu un Kernavu. Gar upes krastu ir saglabājies milzīgs skaits pilskalnu, svēto akmeņu un biržu. Upes krastos atrodas vairākas pilsētas: Nemenčine; Viļņa; Grigishkes; Jonava; Kauņa. Lielākās pietekas ir: Sventoji (Sventoji); Džeimens; Voke (Vaka); Vilnia (Vilnia); Saide; Musa.
Ventas upe
Venta ir upe, kuras gultne iet caur Lietuvas (šeit to sauc par Ventu) un Latvijas teritoriju. Ventas kopējais garums ir 346 kilometri, no kuriem tikai 161 kilometrs iet caur Lietuvas augsni.
Upes avots ir Mädainis un Väniu ezeri (emait Upland teritorija). Pavasara plūdu laikā ūdens augstums upē paaugstinās līdz 7 metriem. Tā kā upes plūsmas virziens ir no dienvidiem uz ziemeļiem, tā sāk atbrīvoties no ledus, sākot no augšteces. Ventas lielākās pietekas ir: Abava; Virvīte; Varduva; Vadakste; Tsietsere.
Nevyazis upe
Nevyazis upe atrodas Lietuvas teritorijā un ir labā Nemanas upes pieteka. Kopējais straumes garums ir 210 kilometri.
Nevyazhis iet gar Litovskajas vidienes zemieni. Sasalšanas periods notiek novembrī-janvārī, bet ūdens sāk atvērt februārī-aprīlī. Upes galvenais ēdiens ir kūstošs sniegs. Bet bez tam tai ir apmēram septiņdesmit pietekas. Makšķerēšana upē ir labi attīstīta.
Šešupes upe
Šešupes ūdeņi ved cauri vairāku valstu teritorijām. Tās ir Polija, Lietuva un Kaļiņingradas apgabals (Krievija). Kopējais straumes garums ir 299 kilometri. No tiem 158 kilometri iet caur Lietuvas zemēm, no kuriem 51 kilometrs ir dabiskā robeža starp Krieviju un Lietuvu.
Upes avots atrodas Baltijas grēdā (netālu no Suvali pilsētas). Upe sasalst apmēram no novembra vidus, un ledus dreifs sākas februāra beigās. Bet tie ir nosacīti nosacījumi, jo viss ir atkarīgs no sala sākuma.